Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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