Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufm1P61961 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms