Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg6P61406 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms