Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms