Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d1P61080 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms