Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P58686 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P58686 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P58686 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P58686 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P58686 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms