Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dpf3P58269 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms