Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtnsP57757 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms