Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms