Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp25P57080 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms