Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd5P56812 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms