Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms