Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms