Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms