Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn5P54830 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms