Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms