Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lbx1P52955 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms