Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms