Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms