Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn1swP51491 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms