Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MipP51180 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MipP51180 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MipP51180 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MipP51180 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms