Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms