Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psen1P49769 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms