Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms