Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp3P49194 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp3P49194 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms