Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox1P48437 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms