Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox2P48432 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox2P48432 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox2P48432 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox2P48432 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox2P48432 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox2P48432 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox2P48432 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms