Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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