Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gli1P47806 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gli1P47806 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms