Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr7P47774 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms