Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3aP47708 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms