Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkn1bP46414 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms