Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms