Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mmp9P41245 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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