Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VhlP40338 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VhlP40338 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VhlP40338 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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