Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpargP37238 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpargP37238 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms