Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms