Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd22P35329 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd22P35329 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms