Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab20P35295 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms