Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab12P35283 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab12P35283 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab12P35283 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab12P35283 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab12P35283 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab12P35283 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms