Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptk2P34152 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms