Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh15P33146 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms