Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc11P31313 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms