Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms