Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa2P31245 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms