Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckmt1P30275 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckmt1P30275 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms