Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VtnP29788 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VtnP29788 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VtnP29788 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VtnP29788 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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