Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcdP28867 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms