Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrbP28704 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms