Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RxraP28700 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RxraP28700 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxraP28700 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms